محمد جمال خلیلیان اشکذری تحصیلات حوزوی را در تابستان سال ۱۳۵۶ در یزد شروع نموده و بعد از پیروزی انقلاب اسلامی (از اول سال ۱۳۵۸) به حوزه علمیه قم آمد و تا سال ۱۳۶۴ دوره سطح را به پایان رسانده و به همراه آن از سال ۱۳۵۹ دوره سطح معارف و فلسفه موسسه در راه حق را نیز گذراند. از سال ۱۳۶۸ در کنار درس خارج فقه و اصول دوره کارشناسی و سپس کارشناسی ارشد رشته اقتصاد را گذرانده و در سال ۱۳۷۵ از پایان نامه خود دفاع نمود. از سال ۱۳۷۶ در کنار دروس حوزوی مقطع دکترای اقتصاد را شروع نموده و در اوائل سال ۱۳۸۳ از رساله خود در زمینه شاخصهای توسعه اقتصادی از دیدگاه اسلام دفاع نموده و در حال حاضر به تدریس و تحقیق در رشته اقتصاد موسسه آموزشی و پژوهشی امام خمینی (ره) مشغول بوده و در درس خارج فقه حضرت آیت الله وحید خراسانی نیز شرکت می نماید.